環境信息系統的內容非常廣泛，主要包括環境數據中心、環境綜合管理業務、環境監測、環境監控、環境應急指揮等各類支撐環境保護管理政務和業務工作的應用系統及其所需的信息化基礎設施。
環境數據中心
環境信息系統中的環境數據具有時間周期長、數據量大、格式不統一等特點，且分散于各個不同的部門、存儲于不同的介質。環境數據中心的目標是通過各種不同數據源之間的數據傳遞、轉換、凈化、集成等功能，實現環境數據的統一采集、統一存儲、統一管理、統一分析、統一展現。從用戶的業務需求出發，對現有的數據資源和處理流程進行綜合分析，以信息資源規劃為標準，通過數據層面的整理提煉，將分散在各個“信息孤島"中的有效信息資源進行全面整合，形成完善的數據中心系統，全面支持數據共享、統一管理和分析決策。通過跨平臺的標準數據協議，將各個獨立分散的數據庫或信息系統中的有價值的數據抽取到數據中心，實現多業務處理以及管理決策層的數據共享。數據中心是業務系統與數據資源進行集中、集成、共享和分析的場地、工具及流程的有機組合。從應用層面來看，數據中心包括業務系統、基于數據倉庫的分析系統；從數據層面看，包括操作型數據、分析型數據以及數據與數據的集成整合流程；從基礎設施層面看，包括服務器、網絡、存儲和整體IT運行維護服務。
環境綜合管理業務系統
環境綜合管理業務系統是根據環境保護業務的管理需要而開發的信息系統，目前較為普遍的主要包括污染源管理類應用系統、總量減排管理類應用系統、環境監察與移動執法管理類系統、生態保護管理類系統及涉及水、氣、聲、渣、固體廢物、核與輻射等環境要素的專業信息系統等。隨著環境保護業務地不斷發展及信息化應用地不斷深入，環境保護業務管理系統也將不斷與時俱進、推陳出新。
行政審批系統
行政審批系統主要包括面向公眾的行政審批網站、面向審批工作人員的網上行政審批平臺、面向監察部門和相關領導的政務監督平臺。行政審批系統的建設解決了公眾和企業網上辦公、審批電子資料共享、相關領導查詢統計監控等方面的問題，以提高行政效率，推行電子政務便捷利民為切入點，將為企業和群眾服務的事項內容、辦理流程、政策法規、所需資料、辦理時限、辦理結果等公之于眾，企業和群眾只要在互聯網上，就可以及時查詢相關的政務信息和各自所要申報事項的所有服務內容，還可通過登錄互聯網下載所要辦理事項的表格，并將申辦資料經過掃描和電子填寫制成電子文檔上傳，即可網上受理。
辦公自動化系統
辦公自動化系統是指組織中為最大限度地提高辦公效率和改進辦公質量，縮短辦公周期建設的重要信息化系統。系統主要內容是建設安全、高效、可控的工作平臺，實現辦公流轉、工作協同、信息共享。政府辦公自動化系統是面向政府機構政務辦公需要開發的綜合政務信息系統。目前辦公自動化系統普遍基于WEB技術，而向政府機構的業務模式、管理模式和服務方式實現流程優化、信息整合和服務擴展，利用信息技術將政府機構的應用從簡單的取代手工勞動提高到工作方式優化的新層次。辦公自動化系統主要包括信息的采集、加工、傳輸和管理四個基本環節；包括公文和文件處理、事務處理、文字處理、檔案處理、日程處理、電子郵件、電子報表、數據處理、信息管理等應用功能。
政府門戶網站
隨著我國政府對可持續發展理念的不斷深化和人民群眾對環境保護工作的熱切關注，各級環境保護機構紛紛建立了政府門戶網站。政府門戶網站定位于“信息公開、在線服務、政民互動"，在深化政府信息公開、正確引導社會輿Lun、不斷完善在線服務和互動交流功能等方面不斷加強制度建設和能力建設。各類數據、信息公開的及時性和有效性不斷提高，數據信息涵蓋環境質量、污染防治、環境影響評價、環保法律法規、自然生態、科技標準、環保產業、核與輻射安全管理、污染源排放總量控制等環保各個業務領域，為廣大社會公眾、企業單位、環境科學研究人員、環境保護公益組織等提供了了解和認識環境保護工作的基礎平臺。
環境監測系統
現代環境監測系統是一套以在線自動分析儀器為核心，運用現代傳感技術、自動測量技術、自動控制技術、計算機應用技術、通信網絡以及相關的專業分析軟件形成的一個綜合性的自動監測系統。各監測予站對監測對象進行自動取樣，并利用監測儀器進行檢測分析，將采集到的監測數據通過采集、存儲、傳輸、統計和分析等處理后，以圖形和報表的形式，通過網絡及時、準確地傳輸給環境保護管理部門，為其提供準確、可靠的決策依據。
同時，通過環境質量信息發布系統將相關信息進行發布，便于公眾實時了解與自身關系緊密的環境質量現狀，提供統一的監測管理、評價與公眾信息獲取平臺。一般情況下，環境監測系統主要包括水質自動監測系統、大氣環境質量在線監測系統、噪聲在線盟測系統等。
污染源自動監控系統
污染源自動監控系統是對排污單位的污染物排放情況(廢水、yan塵氣及放射性等)進行實時、連續、自動監控，并能及時作出相應反饋的系統。它主要包括污染源自動在線監控系統和自動監控指揮中心，利用的自動監控儀器技術、計算機網絡技術、網絡通信技術、數據庫技術等，對排污單位的廢水、yan塵的排放量和主要排污因子的濃度或環境質量參數等指標實現連續自動監測、自動采集監測數據、自動分析處理，并自動將這些數據遠程傳輸至各級管理部門的自動監控指揮中心。指揮中心對環境監測、監控數據進行統一的管理與調用，實現對污染源情況的總體監控，實現對污染源排污情況的統一監測、監控和管理。
污染源自動監控系統主要由以下三部分組成：
監控中心：安裝在各級環境保護管理部門，與傳輸線路和自動監控設備連接，安裝數據接收和數據處理的系統，包括計算機信息終端設備及計算機軟件等，簡稱上位機。
數據采集傳輸儀：包括用于采集各種類型監控儀器儀表的數據，完成數據存儲與上位機數據通信傳輸功能的單片機、工控機、嵌入式計算機、嵌入式可編程自動控制器(PAC)或可編程控制器(PLC)等。
自動監控設備：安裝在現場用于監控環境或污染源排污狀況及完成與上位機的數據通信傳輸的單臺或多臺設備及設施，包括污染源排污監控儀器、流量計、污染治理設施運行記錄儀和數據采集傳輸儀等。
環境應急指揮系統
環境應急指揮系統是信息技術在突發環境事件防范與應急工作中應用的集合體系，是做好環境事件防范和應急工作的技術保障。環境應急指揮系統的建設目標是立足于當前環境應急管理的現狀，以環境風險源的動態管理為核心，建立基于動態聯網管理的風險源動態管理系統、環境應急預案管理系統、環境應急預警預測系統、環境應急輔助決策支持系統、環境應急指揮與調度系統、環境應急通信系統和環境應急處置后期評估系統等。在摸清風險源底數的基礎上建立動態管理機制；建立以風險源自動監控系統和以12369接警系統為基礎的環境應急預警預測機制；實現環境應急預案、應急資源、應急模型的智能化集成；全面提升處置突發應急事件的協調和處置能力。
空間信息管理和發布系統
空間信息管理和發布系統主要實現重點污染源數據、環境管理數據、環境資源數據等的空間管理、發布和展現，提供空間數據的統一管理和共享服務。空間信息數據管理和發布系統由應用服務、數據服務、信息共享發布、服務管理維護等功能構成。應用服務主要包括空間信息統計服務、空間信息分析服務和空問信息功能服務；數據服務包括數據處理、數據存儲、數據備份、數據統一管理等功能；信息共享發布包括成果數據發布、空間信息共享發布和空間信息檢索功能；服務管理維護主要包括用戶及權限管理、服務管理和日志管理功能等 。
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